Machine Learning Scientist - Westerdijk Fungal Biodiversity Institute - Utrecht

The challenge
For this position, we seek a machine learning expert ready to tackle one of the most diverse and under-explored datasets in biology.

Our institute maintains one of the world’s richest fungal strain collections, and we are generating large in-house datasets that are multi-modal and paired with each sample:

• High-resolution images (morphology, microscopy);
• DNA sequences (barcodes, full genomes, transcriptomes); and
• Phenotypic and biochemical profiles (structured/tabular data).

Our datasets are not just big — they’re continuously expanding with tens of thousands of strains, each with matched image, sequence, and phenotype data. On top of our in-house resources, you’ll integrate with external repositories (e.g., GEO, MycoCosm, MIRRI-ERIC, etc.), giving you access to even more omics and microbial data.

You will design the next generation of AI algorithms to:

• Integrate image, sequence, and tabular data in a single modeling framework;
• Build correlation networks across biological and environmental variables;
• Develop scalable pipelines for classification, anomaly detection, and clustering
• Enable rapid, automated species identification at a speed the field has never seen; and
• Create a robust data infrastructure to connect internal and external datasets

“This means you can train and evaluate models on truly linked biological datasets — a rare opportunity in applied AI.”

Why This Matters?
Globally, only a tiny fraction of fungal species has been described. Your work will directly accelerate discovery — compressing what is currently a slow, manual process into an AI-assisted, high-throughput pipeline. By developing AI tools to discover species boundaries, rapidly and accurately identify species, detect pathogens, and predict traits, your work will directly contribute to protecting food security, preventing invasive species, improving early disease diagnosis, and enabling new biotechnological applications. You will not just be advancing AI research — you will deliver solutions with real societal and environmental impact.

"Working at the Westerdijk Fungal Biodiversity Institute — a world of knowledge, innovation, and growth"

What We Are Offering

• A full-time postdoc position in a leading fungal biodiversity institute;
• Opportunities to participate in internal training for soft skills development;
• To become part a cross-disciplinary bioinformatics cluster that blends existing biology expertise with new AI skills;
• Working as team to build a central data platform, integrating analysis pipelines into daily workflows, and making curated datasets openly available to the global research community;
• A chance to advance AI research and deliver solutions with real societal and environmental impact.

“You bring the technical expertise — we will provide the data, the domain experts,and the chance to make a measurable impact in both AI and science.”

Moleculair Biologisch Analist (Research Assistant)

Wat ga je doen?

In deze veelzijdige functie werk je aan een scala van taken binnen onze afdeling en het NIOO. Je werkt niet alleen uitvoerend, maar ook coördinerend en adviserend. Je bent verantwoordelijk voor:

• Biologische veiligheid (BVF): Je bent aanspreekpunt voor BVF-vraagstukken. Je waarborgt een veilige en correcte uitvoering van de werkzaamheden volgens de geldende richtlijnen. Je ontwikkelt en implementeert protocollen en ziet toe op naleving van richtlijnen.
• Beheer van collecties en vriezers: Je organiseert en onderhoudt onze collectie microben, planten en databestanden (o.a. Biolomics) en adviseert over verbeteringen in een overzichtelijke en betrouwbare opslag.
• Ondersteuning en coördinatie van onderzoeksprojecten: Je ondersteunt bij lopende experimenten en onderzoeksactiviteiten en levert hierbij zowel technische als organisatorische bijdragen. Je draagt actief bij aan het draagt bij aan het ontwerp van experimenten, adviseert over methoden en technieken en bewaakt de voortgang.
• Bestelbeheer: Je verzorgt bestellingen van labmaterialen, reagentia en verbruiksartikelen, bewaakt voorraden én adviseert over kostenbeheersing en efficiënt gebruik van middelen.
• Onderhoud en kwaliteitsborging van apparatuur: Je ziet toe op het correct functioneren, validatie en periodiek onderhoud van apparatuur in het microbiologie laboratorium.

Je hebt aantoonbare ervaring met:

• Geavanceerde moleculaire technieken (PCR, sequencing, qPCR, cloneren)
• Microbiologie en werken met planten, bacteriën en virussen
• Ontwikkelen en optimaliseren van protocollen
• Greenhouse-werkzaamheden en bioassays
• Data-analyse en kwaliteitscontrole van onderzoeksresultaten
• Databasebeheer en rapportage

Wie zoeken wij?
Een zelfstandige en pro-actieve teamspeler die nauwkeurig werkt, goed kan plannen, ervaring heeft met biologische veiligheid (BVF taken) en graag bijdraagt aan de kwaliteit en continuïteit van onze onderzoeksprojecten.

• HBO werk- en denkniveau
• Ervaring in moleculaire biologie en microbiologie
• Vermogen om complexe taken te coördineren en prioriteiten te stellen
• Sterke communicatieve vaardigheden en het vermogen om onderzoekers te adviseren
• Ervaring met kwaliteitsborging en veiligheidsprocedures
• Bij voorkeur BVF gecertificeerd, of bereid om de opleiding te volgen

Je krijgt een veelzijdige rol waarin je niet alleen uitvoert, maar ook adviseert, coördineert en kwaliteitsborging verzorgt. Je werkt in een inspirerende onderzoeksomgeving met ruimte voor eigen initiatief en professionele ontwikkeling.

We bieden een interessante positie voor 0,8 fte voor een jaar, met de mogelijkheid tot een vast dienstverband.

Herken jij jezelf in bovenstaande omschrijving? Solliciteer dan snel en versterk ons team!

Head of Publications Department and Executive Editor

Their primary focus will be on the International Review of Social History (IRSH), alongside a coordinating role in the publication programme, which includes four open access journals, an open access Book Series with UCL Press and other key publications.

We are looking for a highly driven and experienced editor with a profound passion for social history, a keen eye for top-tier academic quality, and the strategic vision to elevate one of the most respected journals in the field as well as the publication activities of the International Institute of Social History (IISH) to new heights.

As Head of the Publications Department and Executive Editor of IRSH, you will be the driving force behind and carry the final responsibility for the entire publication process of five journals, several book series and other publications, from initial acquisition to production and publication. You will combine substantive expertise with strategic foresight and strong coordination skills.

Your tasks:

• As Executive Editor, you oversee the entire editing process and publication planning of IRSH, including coordinating Editorial Committee (EC) meetings and meetings with the book series editors. You hold final responsibility for the accepted versions of articles and book manuscripts and the make-up of journal issues and books.
• You direct the peer review process of IRSH and the book series: this involves conducting the initial assessment of incoming submissions, selecting and contacting relevant expert reviewers, and evaluating revisions to accepted articles.
• You monitor the impact of the five journals and the book series, devising editorial policy based on relevant theoretical and substantive developments in the field, and ensuring the reputation and sustainability of the journals and book series.
• You actively ensure a steady and healthy copy flow by engaging in relevant networks, scouting new themes, and commissioning new, high-quality materials.
• You coordinate the editorial, marketing, and commercial developments in close collaboration with national and international publishers and publication platforms.
• You develop the Publications Department's policy in conjunction with the IISH's research, data, and communication strategies. You also advise Research Department members on editing, publication opportunities, Open Access, copyright, and more.

Collectiespecialist Bibliotheek - Meertens

Je werk bestaat in de eerste plaats uit coördinatie van de dagelijkse werkzaamheden van de medewerkers dienstverlening van het Meertens Instituut, en van de medewerkers van de NIAS-bibliotheek en je draagt samen met hen zorg voor de toegankelijkheid en het beheer van de collectie. Je zorgt voor structuur en onderhoudt nauw contact met de teamleider van Data & Erfgoedcollecties. Je verdere taken bestaan uit beleid, dienstverlening, beheer, en acquisitie voor de bibliotheekcollectie; het ontsluiten en onderhouden van bibliotheekinformatie op inter- en intranet; het zorgdragen voor IBL-verkeer; het beheren van het PURE-account (onderzoeksportaal KNAW).

Medewerker Receptie & Facilitair - NIOO-KNAW - Wageningen

In deze functie ben jij het eerste aanspreekpunt voor zowel onze bezoekers als voor je collega’s. Met jouw positieve uitstraling zorg jij voor een warm welkom bij het NIOO. Samen met collega’s help jij de klant verder door het geven van informatie en advies.

Als medewerker Receptie & Facilitair ben je (mede) verantwoordelijk voor de organisatie van kleine en grotere evenementen en het monitoren en het nemen van gewenste acties t.a.v. de facilitaire contracten. Je beheert softwaresystemen voor o.a. het alarm, telefonie en de kassa van de bedrijfskantine.

Daarnaast bestaat de functie o.a. uit de volgende werkzaamheden:

• Bezoekersontvangst en registratie
• Afhandelen van binnenkomende telefoontjes
• Verzorgen van inkomende en uitgaande post en (internationale) pakketten
• Het reserveren van vergaderzalen en (bedrijfs)auto’s
• Het uitvoeren en bewaken van de voortgang van facilitaire verzoeken
• Inkoop van o.a. catering, kantoorartikelen en schoonmaakartikelen
• Introductie en ontvangst nieuwe medewerkers (incl. administratieve verwerking)
• Centraal aanspreekpunt bij calamiteiten