PhD position on Exposing the Contribution of Epialleles to Heritable Variation

To face climate change and other environmental challenges, the capacity for rapid adaptation is crucial for both natural plant populations and crops. Heritable trait variation fuels such adaptation. While heritable trait variation can arise from genetic and epigenetic sources alike, the true contribution of epigenetics to plant adaptation remains uncertain. The primary challenge lies in distinguishing genetic from epigenetic effects and establishing a causal relationship between DNA methylation variants and gene expression.

In a collaborative project between Utrecht University (UU) and the Netherlands Institute of Ecology in Wageningen (NIOO-KNAW), we will tackle these challenges by using an apomictic dandelion lineage as a unique model system. Because apomictic plants reproduce through clonal seeds, they allow us to disentangle genetic from epigenetic effects with unprecedented clarity. The project combines high-resolution analysis of genetic, epigenetic, and gene expression variation between apomictic plants, which exposes putative natural epialleles (PhD project at NIOO-KNAW), with genomic and epigenomic editing that identifies genes regulated by DNA methylation and tests the causal effects of candidate epialleles on gene expression (this PhD project at UU).

In this PhD project you will:

• Develop and use state-of-the-art CRISPR/Cas9-based technologies to target DNA methylation maintenance machinery, inducing genome-wide hypomethylation to identify genes regulated by methylation.
• Deploy an advanced, inducible Suntag-TET1cd epigenomic editing system to target specific candidate epialleles, allowing you to prove the causal link between DNA methylation and gene expression.
• Investigate the transgenerational stability of these epigenetic marks over multiple generations.

This project represents a frontier in ecological epigenetics, marking the first application of epigenomic editing in a wild, non-model plant species. Beyond fundamental evolutionary questions, your work will contribute to the development of new transient (epi)genomic editing tools for asexual plants—technologies with significant potential applications in the improvement and breeding of clonally propagated crops

Promovendus Beleid en Gedrag voor Circulaire Consumptie

In dit door NWO gefinancieerde onderzoek INTRINSIC richten we ons op persoonlijke hygiëneproducten, zoals incontinentiemateriaal, babyluiers en menstruatieproducten. Deze producten zijn een enorme bron van afval in Nederland. De gemiddelde persoon met een menstruatiecyclus gebruikt bijvoorbeeld tussen de 11.000 en 16.000 menstruatieproducten tijdens diens leven, terwijl herbruikbaar maandverband tot wel vijf jaar kan meegaan. De drempel voor het gebruik van duurzame alternatieven ligt, vanwege de privéomgeving waarin deze producten worden gebruikt, vaak hoger dan bij andere producten. Juist daardoor kan INTRINSIC bijdragen aan een bredere maatschappelijke verandering en focus op duurzaamheid.

INTRINSIC is een transdisciplinair onderzoeksproject naar herbruikbare hygiëneproducten en brengt onderzoekers, burgers, overheids- en zorginstellingen, ondernemers en maatschappelijke partners samen om de overgang naar herbruikbare producten in Nederland te versnellen.

Wat ga je doen?
INTRINSIC bestaat uit verschillende deelprojecten. Als promovendus op dit deelproject ga je je bezighouden met het overheidsbeleid en daaruitvolgend gedrag over herbruikbare hygiëneproducten. Hoe zit het beleid nu in elkaar en wat kan beter? Werken bijvoorbeeld subsidies goed, of kunnen burgers het beste worden gestimuleerd met kleine duwtjes (nudges)? En wat is de rol van bedrijven en maatschappelijke stakeholders (bv kinderopvangen, verzorgingshuizen) instellingen) in circulaire transitie naar hergebruikbare hygiënische producten?

Je werkt samen in een team met onderzoekers, van bestuurskundigen tot gedragswetenschappers en juristen. Ook werk je samen met publieke organisaties, ondernemingen en burgers. Je maakt gebruik van verschillende onderzoeksmethoden. Je onderzoekt hoe beleid en regelgeving op elkaar inwerken en waar verbeterpunten liggen. Je voert interviews en vragenlijstonderzoek uit. Je werkt ook mee aan het ontwikkelingen van interventies om duurzaam gedrag te stimuleren en test via veldexperimenten of deze werken.

Je draagt als promovendus na 1 jaar in beperkte mate (0,1 FTE) bij aan het onderwijs binnen het departement Bestuurs- en Organisatiewetenschap en je krijgt de kans om je basiskwalificatie onderwijs (BKO) te starten.

De voertaal is Nederlands en Engels. De wetenschappelijke artikelen en het proefschrift zijn Engelstalig. De impactstukken vooral in het Nederlands.

Kortom: je krijgt de ruimte om je te ontwikkelen tot een veelzijdige onderzoeker, met onderzoek dat er toe doet.

Extern lid Commissie Interpersoonlijke Integriteit

Als extern lid van de Commissie Interpersoonlijke Integriteit maak je deel uit van een onafhankelijke commissie die meldingen ontvangt en klachten onderzoekt over mogelijk grensoverschrijdend gedrag binnen de universitaire context.

Je werkt mee aan de zorgvuldige behandeling van meldingen en klachten en denkt mee over vraagstukken rond sociale veiligheid. Daarbij werk je samen met andere externe deskundigen, medewerkers van de UU, studentleden en een onafhankelijke voorzitter. Klachten worden onderzocht in kleinere, wisselende samenstellingen.

Als extern lid draag je onder meer bij aan:

• het voorbereiden en uitvoeren van klachtenonderzoeken;
• het voeren van gesprekken en interviews met betrokkenen;
• het zorgvuldig wegen van informatie, feiten, belangen en normenkaders;
• het bewaken van een zorgvuldige procedure, waaronder hoor en wederhoor;
• het opstellen van heldere en goed onderbouwde adviezen aan het College van Bestuur over ontvankelijkheid, gegrondheid en mogelijke vervolgstappen of maatregelen;
• het signaleren van terugkerende thema’s en het meedenken over preventief en repressief beleid rond sociale veiligheid;
• het uitdragen van het commissiewerk binnen de universiteit, bijvoorbeeld door mee te denken over beleid of bij te dragen aan gesprekken met faculteiten, diensten of studentenorganisaties.

Postdoctoral researcher on Marine Carbon Dioxide Removal (mCDR:MRV)

Marine carbon dioxide removal (mCDR) is becoming an internationally recognised strategy as a way to mitigate climate change by increasing the ocean’s capacity to store anthropogenic CO2 emissions. Several strategies such as (1) direct ocean carbon capture, and (2) ocean alkalinity enhancement, manipulate ocean carbonate chemistry via electrochemical methods or alkalinity addition (enhanced rock weathering or via alkaline fluids), respectively. Both methods are beginning early pilot trail stages throughout European coastal waters; however, scientific research is lacking with respect to assessing the biological and ecological impacts of these mCDR approaches.

This EU-funded project is in collaboration with an international consortium of researchers and industry partners that will assess mCDR via monitoring, reporting and verification (MRV). Specifically, as the new postdoctoral researcher you will integrate ecological MRV (eMRV) approaches, that are essential for the deployment of mCDR strategies, via the assessment of ecological functions, biodiversity impacts, and potential consequences for human health effects. You will help design, implement, and conduct in situ observation studies with partnered pilot sites (in the Baltic, Mediterranean, and Atlantic) complemented with laboratory experiments to build an eMRV framework supplementing traditional MRV. Observational approaches include deployment of passive chemical samplers, quantifying organic matter export, examining eDNA functional responses, and monitoring shifts in POC and biogenic silica. Laboratory studies will target the response of benthic fluxes associated with changes in overlying seawater based on pilot site mCDR strategy.

PhD position: Competition Law Enforcement in Mixed Markets

State ownership has been rediscovered across the EU for industrial policy purposes, proving effective in the pursuit of strategic autonomy and sustainability transitions. State-owned enterprises (SOEs) are historically prominent in critical markets such as energy, extraction, utilities, finance and transportation, while allowing for more government influence than in private firms.

The above developments have led to a resurgence of state ownership through nationalization, active shareholding and subsidization in the EU, creating new risks for so-called mixed markets, where SOEs and private firms compete. This, in turn, raises questions about competition law enforcement of such markets. SOEs may be inclined to behave anticompetitively and create obstacles for private enterprises. However, there is little understanding of how competition law is enforced against SOEs in practice. This PhD research seeks to establish the first empirical insights into the practice and constraints of competition law enforcement against SOEs.

• As PhD researcher, you will undertake a 4-year research project aimed at answering to what extent, and on what grounds, the enforcement of EU competition law differs between State-owned enterprises and private undertakings.
• This PhD project envisions a mixed methods approach, combining data-driven, experimental and qualitative methodologies.
• The envisioned output of this PhD is 4 academic articles suitable for publication in peer-reviewed academic journals in competition law or policy.
• Throughout this project you will work in close collaboration with two dedicated PhD supervisors, who will coach you towards becoming an independent academic researcher.
• The proposal for this PhD project is attached. There, you find more details about its provisional aims and structure. This proposal should not be considered as entirely prescriptive—you are encouraged to make this project your own in consultation with your supervisors.